Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
O00370 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
O00370 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
O00370 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms