Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ERVH48-1M5A8F1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ERVH48-1M5A8F1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ERVH48-1M5A8F1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ERVH48-1M5A8F1 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ERVH48-1M5A8F1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ERVH48-1M5A8F1 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ERVH48-1M5A8F1 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ERVH48-1M5A8F1 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ERVH48-1M5A8F1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ERVH48-1M5A8F1 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ERVH48-1M5A8F1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ERVH48-1M5A8F1 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ERVH48-1M5A8F1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ERVH48-1M5A8F1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ERVH48-1M5A8F1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVH48-1M5A8F1 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ERVH48-1M5A8F1 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ERVH48-1M5A8F1 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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