Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms