Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA6BA6NDN3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms