Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PALD1Q9ULE6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PALD1Q9ULE6 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PALD1Q9ULE6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PALD1Q9ULE6 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PALD1Q9ULE6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PALD1Q9ULE6 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PALD1Q9ULE6 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PALD1Q9ULE6 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms