Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms