Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms