Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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