Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms