Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP1Q9C000 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms