Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms