Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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