Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC4Q92889 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms