Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms