Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms