Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms