Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMUB2Q71RG4 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms