Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4L3Q6VB84 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms