Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms