Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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