Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDR2Q16832 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.1 ms