Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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