Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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