Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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