Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms