Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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