Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUSP4Q13115 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP4Q13115 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP4Q13115 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP4Q13115 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP4Q13115 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP4Q13115 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUSP4Q13115 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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DUSP4Q13115 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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DUSP4Q13115 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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