Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms