Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms