Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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IFFO1Q0D2I5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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