Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
LRP1Q07954 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms