Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CPEB4-203ENST00000517880 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC092687.2-201ENST00000452909 568 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC008434.1-201ENST00000514201 549 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PTH-201ENST00000282091 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 VPS53-203ENST00000401468 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC074051.1-201ENST00000470389 781 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 POLB-211ENST00000521492 786 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms