Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPIBQ01892 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms