Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK17Q00537 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms