Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG7P83436 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG7P83436 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG7P83436 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms