Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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