Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSCP56915 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSCP56915 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms