Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E1P51965 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms