Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCLMP48507 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCLMP48507 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCLMP48507 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCLMP48507 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCLMP48507 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCLMP48507 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCLMP48507 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCLMP48507 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCLMP48507 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLMP48507 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms