Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZEB1P37275 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZEB1P37275 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZEB1P37275 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZEB1P37275 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZEB1P37275 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ZEB1P37275 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZEB1P37275 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZEB1P37275 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZEB1P37275 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZEB1P37275 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZEB1P37275 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZEB1P37275 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ZEB1P37275 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZEB1P37275 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZEB1P37275 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZEB1P37275 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms