Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H1P32780 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H1P32780 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H1P32780 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H1P32780 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H1P32780 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H1P32780 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H1P32780 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H1P32780 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H1P32780 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H1P32780 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H1P32780 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H1P32780 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H1P32780 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2H1P32780 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms