Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PLNP26678 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PLNP26678 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms