Protein–RNA interactions for Protein: P25787

PSMA2, Proteasome subunit alpha type-2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA2P25787 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA2P25787 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms