Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRHP20396 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 C3orf18-202ENST00000422619 551 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 AL139412.1-201ENST00000441085 523 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC006372.1-201ENST00000449903 546 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC016735.1-201ENST00000457457 237 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 uc_338.24-201ENST00000617802 182 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 RNF141-202ENST00000528665 1374 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRHP20396 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 VAMP1-204ENST00000535180 747 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 PIMREG-209ENST00000576056 833 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRHP20396 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 BX284656.1-201ENST00000446364 668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 MIR2277-201ENST00000515916 93 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC121757.1-201ENST00000552441 624 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 AP001180.4-201ENST00000584167 823 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms