Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms