Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ITGB6P18564 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ITGB6P18564 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ITGB6P18564 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ITGB6P18564 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ITGB6P18564 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ITGB6P18564 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ITGB6P18564 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ITGB6P18564 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ITGB6P18564 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ITGB6P18564 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ITGB6P18564 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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