Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms