Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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