Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms