Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTN1P12814 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms